十二指腸狹窄應與先天性肥厚性幽門狹窄和十二指腸閉鎖的鑒別見。
十二指腸狹窄還應與環狀胰腺、迷走腹膜帶扭轉、十二指腸扭結、移位或旋轉的盲腸外部壓迫、迷走的腸系膜上動脈或十二指腸前門靜脈等因素所致的部分腸梗阻相鑒別。鋇餐檢查、鋇灌腸及腹部B超等檢查有助于鑒別診斷。但病因鑒別比較困難,常需術中明確診斷。
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