游離型核糖體合成的是胞內蛋白,即合成后在此細胞內部發揮作用的蛋白質.如染色體上的蛋白質、細胞膜上的蛋白質、線粒體和葉綠體及細胞質基質中的酶.
附著在內質網上的核糖體合成的是分泌蛋白,即合成后要分泌到細胞外的蛋白質.如一些消化酶、激素等.
真核細胞中,核糖體進行蛋白質合成時,既可以游離在細胞質中,稱為游離核糖體(freeribosome).也可以附著在內質網的表面,稱為膜旁核糖體或附著核糖體.參與構成RER,稱為固著核糖體或膜旁核糖體,是以大亞基圓錐形部與膜接著游離核糖體(freeribosome)..分布在線粒體中的核糖體,比一般核糖體小,約為55S(35S和25S大、小亞基),稱為胞器或線粒體核體.
附著于內質網上的核糖體所合成的蛋白質,與游離于細胞基質中的核糖體所合成的蛋白質有所不同.附著于內質網上的核糖體,主要是合成某些專供輸送到細胞外面的分泌物質,如抗體、酶原或蛋白質類的激素等,游離核糖體所合成的蛋白質,多半是分布在細胞基質中或供細胞本身生長所需要的蛋白質分子(包括酶分子).此外還合成某些特殊蛋白質,如紅細胞中的血紅蛋白等.因此,在分裂活動旺盛的細胞中,游離核糖體的數目就比較多,而且分布比較均勻.這一點已被用來作為辨認腫瘤細胞的標志之一.
