病毒性咽頰炎的治療主要以抗病毒抗感染為主，而且最好是中西醫結合以做到辯證治療，這樣能夠快速的減輕患者的痛苦。患者可以使用中藥進行調理，同時需要服用解毒利咽的藥物協助緩解癥狀。患者體內的毒素和內火比較大，平時就要經常使用板藍根泡水飲用，也可以喝雙黃連等幫助機體化濕退熱，飲食方面不能食用容易上火的食物，也要多讓室內通風透氣。