一、發病原因
新生兒生理性黃疸產生的原因主要有三方面：
1.是新生兒膽紅素代謝的特點所決定，胎兒出生后由于血氧分壓突然升高，紅細胞破壞很快，產生較多膽紅素，而新生兒肝酶活力低，無法清除過多的膽紅素，因而發生黃疸。
膽紅素生成多 膽紅素生成較多原因有：
(1)紅細胞破壞多：胎兒在宮內處于低氧環境，紅細胞代償性增多，但壽命短，出生后血氧含量增高，過多的紅細胞被迅速破壞。
(2)血紅素加氧酶含量高：在生后7天內含量高，產生膽紅素的潛力大。
(3)旁路膽紅素來源多。
2.是消化系統不成熟
1肝功能不成熟
(1)肝結合膽紅素功能差：肝內葡萄糖醛酸轉移酶含量低且活力不足，形成結合膽紅素的功能差。
(2)肝攝取膽紅素能力差：肝細胞內Y、Z蛋白含量不足，使肝對膽紅素攝取不足。
(3)肝排泄膽紅素功能差：排泄結合膽紅素的功能差，易致膽汁淤積。
2腸-肝循環特點 新生兒剛出生時腸道內正常菌群尚未建立，不能將進入腸道的膽紅素轉化為尿膽原(糞膽原)，且新生兒腸道內β-葡萄糖醛酸苷酶活性較高，將腸道內的結合膽紅素水解成葡萄糖醛酸和未結合膽紅素，后者又被腸壁吸收經門靜脈達肝臟。
最后還有一方面，新生兒黃疸多發生于母乳喂養的孩子，因此，母乳中的化學物質和激素是引起新生兒黃疸的又一原因，但這種黃疸多為生理性黃疸，對新生兒沒有危害，應鼓勵母親繼續母乳喂養。
由于上述特點，新生兒攝取、結合、排泄膽紅素的能力明顯不及成人，且膽紅素產生多而排泄少，因此，極易出現黃疸。尤其在缺氧、胎糞排出延遲、喂養延遲、嘔吐、脫水、酸中毒、頭顱血腫等情況時會加重黃疸。
二、發病機制
生理性黃疸的發生與新生兒膽紅素代謝的特點有關。
胎齡12周時，羊水中已有膽紅素。這是由胎兒氣管和支氣管樹分泌到羊水中的未結合膽紅素。胎兒紅細胞破壞后產生的未結合膽紅素，極大部分通過胎盤到母體循環去清除，故新生兒剛出生時都無黃疸。
出生后，新生兒必須自己處理血紅蛋白的代謝產物一未結合膽紅素。但葡萄糖醛酰轉移酶在足月兒要3～5天、未成熟兒要5～7天才成熟。加諸概述中已提及的各種新生兒膽紅素代謝特點，就發生新生兒生理性黃疸。
