細菌性腹瀉是腹瀉的一種，可分為急性菌痢和慢性菌痢兩種。急性菌痢的話患者會表現出惡心嘔吐、腹痛、膿血便、高燒等；慢性菌痢的話沒有特別的癥狀，長期不予治療的話會表現出膿便等。

主要有全身中毒癥狀與消化道癥狀，可分成四型：

（1）普通型（典型）起病急，有中度毒血癥表現，畏寒、發熱達39℃、乏力、食欲減退、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、里急后重。先為稀水樣便，1～2天后稀便轉成膿血便，每日排便數十次，量少，失水不顯著。常伴腸鳴音亢進和左下腹壓痛。一般病程10～14天。

（2）輕型（非典型）全身中毒癥狀、腹痛、里急后重、左下腹壓痛均不明顯，可有低熱、糊狀或水樣便，混有少量黏液，無膿血，一般腹瀉次數每日10次以下。糞便鏡檢有紅、白細胞，培養有痢疾桿菌生長，可以此與急性腸炎相鑒別。一般病程3～6天。

（3）重型.多見于年老體弱或營養不良的患者。有嚴重全身中毒癥狀及腸道癥狀。起病急、高熱、惡心、嘔吐，劇烈腹痛及腹部（尤為左下腹）壓痛，里急后重明顯，膿血便，便次頻繁，甚至失禁。病情進展快，明顯失水，四肢發冷，極度衰竭，易發生休克。

（4）中毒型.此型多見于2～7歲體質好的兒童。起病急驟，全身中毒癥狀明顯，高熱達40℃以上，患者精神萎靡、面色青灰、四肢厥冷、呼吸微弱、皮膚花紋、反復驚厥、嗜睡，甚至昏迷，而腸道炎癥反應極輕。按臨床表現可分為休克型（以感染性休克為主要表現）、腦型（以中樞神經系統癥狀為主要表現）和混合型（兼具以上兩型的表現，最為兇險）。這是由于痢疾桿菌內毒素的作用，并且可能與某些兒童的特異性體質有關。

菌痢患者可反復發作或遷延不愈達2個月以上，可能與急性期治療不當或致病菌種類（福氏菌感染易轉為慢性）有關，也可能與全身情況差或胃腸道局部有慢性疾患有關。主要病理變化為結腸潰瘍性病變，潰瘍邊緣可有息肉形成，潰瘍愈合后留有瘢痕，導致腸道狹窄。分型如下：

（1）慢性隱匿型.患者有菌痢史，但無臨床癥狀，大便病原菌培養陽性，作乙狀結腸鏡檢查可見黏膜炎癥或潰瘍等菌痢的表現。

（2）慢性遷延型.患者有急性菌痢史，長期遷延不愈，腹脹或長期腹瀉，黏液膿血便，長期間歇排菌，為重要的傳染源。

（3）慢性型急性發作.患者有急性菌痢史，急性期后癥狀已不明顯，受涼、飲食不當等誘因致使癥狀再現，但較急性期輕。